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Aplicação de técnicas de RMN ao estudo de separação de fases líquido-líquido de proteínasOrientador: Eurico J. Cabrita (Ciência ID: 4814-5DDB-D43D)Tipologia de bolsa: BIObjectivo: Desenvolvimento da aplicação da ressonância magnética nuclear para o estudo do processo de separação de fases líquido-líquido de proteínas envolvidas em doenças neurodegenerativas.
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Reconhecimento Molecular do antigénio LacdiNAc pela lectina do tipo galactose presente em macrófagosOrientador: Filipa Marcelo (Ciência ID: 2B1E-5587-3DF2)Tipologia de bolsa: BIObjectivo: Caracterização bioquímica e espectroscópica do citocromo c2 de Neisseria gonorrhoeae, em que o aluno irá desenvolver aptidões nas áreas de biologia molecular, expressão heteróloga de proteínas, purificação e sua caracterização.
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Aplicação de técnicas bioquímicas ao estudo do citocromo c2 de Neisseria gonorrhoeaeOrientador: Sofia R. Pauleta (Ciência ID: 461F-769F-0046)Tipologia de bolsa: BIObjectivo: Caracterização bioquímica e espectroscópica do citocromo c2 de Neisseria gonorrhoeae, em que o aluno irá desenvolver aptidões nas áreas de biologia molecular, expressão heteróloga de proteínas, purificação e sua caracterização.
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Caracterização cinética da nitrito reductase de Neisseria gonorrhoeaeOrientador: Sofia R. Pauleta (Ciência ID: 461F-769F-0046)Tipologia de bolsa: BIObjectivo: O projecto foca-se no estudo da cinética de estado estacionário desta metaloenzima. Durante deste projeto, o aluno desenvolverá competências experimentais em cinética enzimática, assim como na caracterização espectroscópica de enzimas com centros de cobre.
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Engenharia de proteínas para optimização da produção de bioenergia de origem microbianaOrientador: Carlos A. Salgueiro (Ciência ID: A617-D83D-1A71)Tipologia de bolsa: BIIObjectivo: Produção e caracterização de variantes de proteínas intervenientes em processos de transferência electrónica extracelular por técnicas bioquímicas e biofísicas. O estudo servirá de base à implementação de metodologias de optimização para produção sustentável de bioenergia por bactérias electrogénicas.
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Identificação de parceiros redox em GeobacterOrientador: Leonor Morgado (Ciência ID: D818-6515-64DC)Tipologia de bolsa: BIIObjectivo: Identificação por ressonância magnética nuclear de parceiros redox de um novo citocromo membranar directamente envolvido no transporte extracelular de electrões em Geobacter sulfurreducens.
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Especificidade da endolisina Twort contra S. aureus usando a técnica de Ressonância Magnética NuclearOrientador: Jorge S. Dias (Ciência ID: 851A-6502-159B)Tipologia de bolsa: BIObjectivo: Interação da endolisina Twort com peptidoglicano extraído de S. aureus, S. epidermidis e S. simulans; Caracterização estrutural da interação da endolisina Twort com muropéptidos derivados de S. aureus por RMN.
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Purificação por afinidade de HRPII de Plasmodium falciparum de sangue infetado com malária, usando nanoestrelas plasmónicas de ouroOrientador: Ricardo Franco (Ciência ID: 9317-7493-96B7)Tipologia de bolsa: BIObjectivo: Desenvolvimento de um método simples e baseado em centrifugação para purificação de proteínas ricas em histidinas a partir de meio complexo, recorrendo a nanoestrelas plasmónicas de ouro revestidas com Ni-NTA, seguido de deteção por espetroscopia de Raman aumentada pela superfície (SERS).
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Interação proteína-glicano no reconhecimento do epitélio gastro-intestinal pelo microbioma humanoOrientador: Angelina S. Palma e Ana Luísa Carvalho (Ciência ID: 6719-0FF9-816A e 351C-DCB9-6912)Tipologia de bolsa: BIObjectivo: Implementação de microarrays funcionais de glicanos, termoforese em microescala e de cristalografia de raios-X para o estudo a nível molecular da interação de proteínas da superfície celular da bactéria comensal Bacteroides thetaiotaomicron com glicanos típicos do epitélio gastro-intestinal.
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Desenho de novas proteínas para a saúde que capitalizem na especificidade única da MalectinaOrientador: Benedita A. Pinheiro (Ciência ID: CB17-E1B7-4EE7)Tipologia de bolsa: BIObjectivo: Caracterização da interação da malectina com N-glicanos. Modificação da especificidade para o reconhecimento de outros tipos de glicosilação em proteínas do retículo endoplasmático. Estudos serão realizados por mutagénese, microarrays, MST e outros métodos complementares.
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Diabetes tipo II - Estudos bioquimicos e estruturais para melhorar a biodisponibilidade de farmacos para hlGP.Orientador: Márcia Correia (Ciência ID: 1111-FE8C-4A3D)Tipologia de bolsa: BIObjectivo: Serão validados experimentalmente por ensaios in vitro, a potência e a eficiência de novos flavonóides que inibem uma das enzima chave do metabolismo da diabetes, a glicogênio fosforilase (GP). Será utilizada uma variedadede técnicas experimentais, tais como expressão, purificação e analise bioquímica de proteínas, estudos de interação proteína-ligando por MicroScale Thermoforesis (MST) e estudos enzimáticos.
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PHA sintetase: mecanismo catalítico e estrutura 3DOrientador: Cristiano Sousa Mota (Ciência ID: BA13-C0DD-E826)Tipologia de bolsa: BIObjectivo: Produção, caracterização bioquímica e cristalização de uma polihidroxialcanoato (PHA) sintetase de Pseudomonas mandelii. Análise estrutural e identificação dos resíduos que conferem especificidade para o substrato.
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A utilização da espectroscopia de Infravermelho na caracterização de polímeros biológicos.Orientador: Pedro Tavares (Ciência ID: 3E1D-D482-2A7C)Tipologia de bolsa: BIObjectivo: Neste projeto pretende-se utilizar a espectroscopia de FTIR para caracterizar um conjunto de proteínas recombinantes com diferentes características espectrais e funcionalidades. Os dados de FTIR serão interpretados em termos das frequências de vibração específicas das ligações peptídicas que podem ser interpretadas em termos quantitativos e qualitativos.
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Utilização de nanogaiolas proteicas em aplicações bioquímicas e biotecnológicas.Orientador: Alice S. Pereira (Ciência ID: 5F11-2A69-C26C)Tipologia de bolsa: BIObjectivo: Neste projeto pretende-se utilizar diferentes nanogaiolas biológicas para promover nesta mesma cavidade interior a síntese de outros minerais e moléculas de interesse biológico. Serão utilizadas técnicas de DNA recombinante, bioquímicas e espectroscópicas para obter e caracterizar nanogaiolas proteicas recombinantes.
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Estudos estruturais da alfa-sinucleína acetilada sob a influência de metabolitos carregados.Orientador: Aldino Viegas (Ciência ID: C411-0563-3D6B)Tipologia de bolsa: BIIObjectivo: A proposta de investigação tem como objetivo investigar a influência de metabólitos comuns na agregação de α-syn e N-Ac-α-syn, bem como caracterizar possíveis locais de interação por RMN.